Блок ZKE как мне кажется должен работать как-то аналогично блоку центр.замка, т.е. в закрытом положении ничего работать не должно. Попробуй эмулировать сигнал с приводов замков зверей что машина открыта. А вообще почему бы не подключить вообще все через ZKE? Имхо дозакрывание и комфортное открывание окон не будут работать если на ZKE не будет сигнала об открывании/закрывании дверей.
И еще, может подключить стеклоподы к комфорт реле по схеме для ZVM? останутся лишние провода просто напросто (это я наугад, в схемы еще не вникал)